Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21O60216 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD21O60216 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD21O60216 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD21O60216 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD21O60216 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD21O60216 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD21O60216 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD21O60216 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD21O60216 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD21O60216 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD21O60216 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD21O60216 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD21O60216 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD21O60216 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD21O60216 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD21O60216 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD21O60216 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD21O60216 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD21O60216 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD21O60216 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD21O60216 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD21O60216 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD21O60216 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RAD21O60216 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RAD21O60216 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD21O60216 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD21O60216 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD21O60216 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD21O60216 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD21O60216 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD21O60216 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD21O60216 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD21O60216 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD21O60216 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21O60216 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21O60216 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21O60216 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21O60216 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21O60216 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21O60216 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21O60216 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21O60216 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21O60216 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21O60216 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21O60216 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21O60216 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21O60216 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21O60216 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD21O60216 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD21O60216 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD21O60216 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD21O60216 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD21O60216 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD21O60216 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD21O60216 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD21O60216 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD21O60216 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD21O60216 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD21O60216 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD21O60216 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD21O60216 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD21O60216 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD21O60216 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD21O60216 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD21O60216 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD21O60216 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD21O60216 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD21O60216 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD21O60216 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD21O60216 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD21O60216 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD21O60216 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD21O60216 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD21O60216 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD21O60216 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD21O60216 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD21O60216 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD21O60216 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD21O60216 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD21O60216 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms