Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDB2O43679 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LDB2O43679 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDB2O43679 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDB2O43679 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDB2O43679 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDB2O43679 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDB2O43679 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDB2O43679 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDB2O43679 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDB2O43679 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDB2O43679 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDB2O43679 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDB2O43679 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDB2O43679 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDB2O43679 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDB2O43679 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDB2O43679 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDB2O43679 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDB2O43679 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDB2O43679 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDB2O43679 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDB2O43679 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDB2O43679 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDB2O43679 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDB2O43679 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDB2O43679 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDB2O43679 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LDB2O43679 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LDB2O43679 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LDB2O43679 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LDB2O43679 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LDB2O43679 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LDB2O43679 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDB2O43679 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDB2O43679 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDB2O43679 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDB2O43679 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDB2O43679 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDB2O43679 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDB2O43679 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDB2O43679 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDB2O43679 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LDB2O43679 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDB2O43679 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDB2O43679 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDB2O43679 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDB2O43679 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDB2O43679 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDB2O43679 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDB2O43679 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDB2O43679 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDB2O43679 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDB2O43679 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDB2O43679 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDB2O43679 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDB2O43679 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDB2O43679 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms