Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms