Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
VPREB3Q9UKI3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms