Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms