Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms