Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD7Q8N8D1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCD7Q8N8D1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD7Q8N8D1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD7Q8N8D1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD7Q8N8D1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD7Q8N8D1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD7Q8N8D1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD7Q8N8D1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD7Q8N8D1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD7Q8N8D1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms