Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF38BQ5VTL8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.7 ms