Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms