Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RRN3P1Q2M238 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RRN3P1Q2M238 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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RRN3P1Q2M238 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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RRN3P1Q2M238 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RRN3P1Q2M238 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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