Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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