Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SS18Q15532 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SS18Q15532 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SS18Q15532 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SS18Q15532 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SS18Q15532 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SS18Q15532 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SS18Q15532 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SS18Q15532 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SS18Q15532 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SS18Q15532 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SS18Q15532 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SS18Q15532 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SS18Q15532 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SS18Q15532 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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