Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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COL19A1Q14993 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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COL19A1Q14993 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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COL19A1Q14993 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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COL19A1Q14993 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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