Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NID2Q14112 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NID2Q14112 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NID2Q14112 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NID2Q14112 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NID2Q14112 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NID2Q14112 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NID2Q14112 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NID2Q14112 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NID2Q14112 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NID2Q14112 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NID2Q14112 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NID2Q14112 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NID2Q14112 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NID2Q14112 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NID2Q14112 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NID2Q14112 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NID2Q14112 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NID2Q14112 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NID2Q14112 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NID2Q14112 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NID2Q14112 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NID2Q14112 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NID2Q14112 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NID2Q14112 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NID2Q14112 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NID2Q14112 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NID2Q14112 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NID2Q14112 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NID2Q14112 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NID2Q14112 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NID2Q14112 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NID2Q14112 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NID2Q14112 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NID2Q14112 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NID2Q14112 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NID2Q14112 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NID2Q14112 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NID2Q14112 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NID2Q14112 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NID2Q14112 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NID2Q14112 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NID2Q14112 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NID2Q14112 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NID2Q14112 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NID2Q14112 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NID2Q14112 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NID2Q14112 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NID2Q14112 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NID2Q14112 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NID2Q14112 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NID2Q14112 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NID2Q14112 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NID2Q14112 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NID2Q14112 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NID2Q14112 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NID2Q14112 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NID2Q14112 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NID2Q14112 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NID2Q14112 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NID2Q14112 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NID2Q14112 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NID2Q14112 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID2Q14112 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NID2Q14112 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NID2Q14112 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NID2Q14112 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NID2Q14112 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NID2Q14112 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NID2Q14112 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NID2Q14112 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NID2Q14112 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NID2Q14112 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NID2Q14112 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NID2Q14112 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NID2Q14112 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NID2Q14112 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NID2Q14112 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NID2Q14112 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NID2Q14112 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NID2Q14112 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NID2Q14112 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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