Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	Q05541	YIL156W-A	YIL156W-A	402 nt		5.2	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	YAL034C-B	YAL034C-B	354 nt		5.2	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	YJR128W	YJR128W	360 nt		5.2	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	RCN1	YKL159C	636 nt		5.2	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	TEM1	YML064C	738 nt		5.2	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	TOM7	YNL070W	183 nt		5.2	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	YNR025C	YNR025C	360 nt		5.2	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	PFK27	YOL136C	1194 nt		5.2	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	PSF3	YOL146W	585 nt		5.2	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	DSS4	YPR017C	432 nt		5.2	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	MRPL27	YBR282W	441 nt		5.2	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	UTP5	YDR398W	1932 nt		5.2	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	RUB1	YDR139C	234 nt		5.19	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	HTB1	YDR224C	396 nt		5.19	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	BSC2	YDR275W	708 nt		5.19	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	YIL171W	YIL171W	330 nt		5.19	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	FMP33	YJL161W	543 nt		5.19	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	SUB1	YMR039C	879 nt		5.19	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	DLT1	YMR126C	1029 nt		5.19	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	GPI12	YMR281W	915 nt		5.19	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	HPA2	YPR193C	471 nt		5.19	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	YBR287W	YBR287W	1284 nt		5.19	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	DSL1	YNL258C	2265 nt		5.19	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	AIM14	YGL160W	1713 nt		5.19	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	PRP43	YGL120C	2304 nt		5.19	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	YOR365C	YOR365C	2112 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	PTR3	YFR029W	2037 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	DSE1	YER124C	1722 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	SFI1	YLL003W	2841 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	ORC4	YPR162C	1590 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	GRX3	YDR098C	858 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	YDR355C	YDR355C	303 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	BUD13	YGL174W	801 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	tQ(UUG)E1	tQ(UUG)E1	72 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	tQ(UUG)H	tQ(UUG)H	72 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	tQ(UUG)L	tQ(UUG)L	72 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	RAD27	YKL113C	1149 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	TVP38	YKR088C	1014 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	REH1	YLR387C	1299 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	IBD2	YNL164C	1056 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	TPD3	YAL016W	1908 nt		5.18	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	SWP82	YFL049W	1872 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	MDM30	YLR368W	1797 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	DOG2	YHR043C	741 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	DOG1	YHR044C	741 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	UTP11	YKL099C	753 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	YPT6	YLR262C	648 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	YIM1	YMR152W	1098 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	RPS11B	YBR048W	471 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	SAT4	YCR008W	1812 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	ALR2	YFL050C	2577 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	MET4	YNL103W	2019 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	YDR261W-A	YDR261W-A	1317 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	LAS1	YKR063C	1509 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	RSC58	YLR033W	1509 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	PGM2	YMR105C	1710 nt		5.17	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	KRE29	YER038C	1395 nt		5.16	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	RCR2	YDR003W	633 nt		5.16	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	IRC22	YEL001C	678 nt		5.16	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	YGL041W-A	YGL041W-A	465 nt		5.16	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	YGR026W	YGR026W	837 nt		5.16	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	AUR1	YKL004W	1206 nt		5.16	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		5.16	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	YAL065C	YAL065C	387 nt		5.16	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		5.16	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	SUA7	YPR086W	1038 nt		5.16	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	GDT1	YBR187W	843 nt		5.16	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	HOM3	YER052C	1584 nt		5.16	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	SEG2	YKL105C	3399 nt		5.16	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	NAM2	YLR382C	2685 nt		5.15	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	BOP2	YLR267W	1713 nt		5.15	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	UBX5	YDR330W	1503 nt		5.15	□□□□□ -1.58
NSE3	Q05541	TSC13	YDL015C	933 nt		5.15	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	YGL242C	YGL242C	546 nt		5.15	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	YKL091C	YKL091C	933 nt		5.15	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	YLR271W	YLR271W	825 nt		5.15	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	MOH1	YBL049W	417 nt		5.15	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	TPT1	YOL102C	693 nt		5.15	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	YOR366W	YOR366W	354 nt		5.15	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	RET3	YPL010W	570 nt		5.15	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	CUP9	YPL177C	921 nt		5.15	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	EGT2	YNL327W	3126 nt		5.15	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	SSU1	YPL092W	1377 nt		5.15	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	ADP1	YCR011C	3150 nt		5.14	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	RPL13A	YDL082W	600 nt		5.14	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	YDR535C	YDR535C	501 nt		5.14	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	PIR3	YKL163W	978 nt		5.14	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	YML119W	YML119W	1074 nt		5.14	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	FIG1	YBR040W	897 nt		5.14	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	PPT2	YPL148C	522 nt		5.14	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	TAF12	YDR145W	1620 nt		5.14	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	OPT2	YPR194C	2634 nt		5.14	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	CUE3	YGL110C	1875 nt		5.13	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	MSS4	YDR208W	2340 nt		5.13	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	SDS23	YGL056C	1584 nt		5.13	□□□□□ -1.59
NSE3	Q05541	OCA5	YHL029C	2040 nt		5.13	□□□□□ -1.59

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