Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms