Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERV-K104P61576 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms