Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A3P48751 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC4A3P48751 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A3P48751 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A3P48751 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A3P48751 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A3P48751 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A3P48751 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms