Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2BP42772 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKN2BP42772 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKN2BP42772 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKN2BP42772 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2BP42772 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2BP42772 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2BP42772 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms