Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ITGAEP38570 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
ITGAEP38570 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms