Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTHFD1P11586 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MTHFD1P11586 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD1P11586 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD1P11586 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD1P11586 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD1P11586 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD1P11586 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD1P11586 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD1P11586 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD1P11586 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD1P11586 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD1P11586 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD1P11586 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD1P11586 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD1P11586 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFD1P11586 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD1P11586 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD1P11586 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD1P11586 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD1P11586 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD1P11586 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD1P11586 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD1P11586 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFD1P11586 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFD1P11586 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFD1P11586 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFD1P11586 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFD1P11586 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFD1P11586 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFD1P11586 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFD1P11586 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFD1P11586 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFD1P11586 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms