Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFLP07196 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFLP07196 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFLP07196 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFLP07196 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFLP07196 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFLP07196 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFLP07196 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFLP07196 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFLP07196 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFLP07196 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFLP07196 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFLP07196 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFLP07196 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFLP07196 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFLP07196 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFLP07196 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFLP07196 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFLP07196 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFLP07196 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFLP07196 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFLP07196 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFLP07196 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFLP07196 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFLP07196 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFLP07196 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFLP07196 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFLP07196 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFLP07196 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFLP07196 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFLP07196 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEFLP07196 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEFLP07196 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEFLP07196 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEFLP07196 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEFLP07196 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NEFLP07196 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEFLP07196 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFLP07196 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFLP07196 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFLP07196 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFLP07196 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFLP07196 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFLP07196 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFLP07196 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFLP07196 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFLP07196 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFLP07196 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFLP07196 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFLP07196 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFLP07196 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFLP07196 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFLP07196 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFLP07196 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFLP07196 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFLP07196 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFLP07196 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFLP07196 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFLP07196 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFLP07196 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFLP07196 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFLP07196 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFLP07196 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFLP07196 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFLP07196 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFLP07196 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFLP07196 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFLP07196 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFLP07196 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFLP07196 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFLP07196 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFLP07196 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFLP07196 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFLP07196 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFLP07196 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFLP07196 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFLP07196 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFLP07196 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFLP07196 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFLP07196 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFLP07196 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFLP07196 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFLP07196 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFLP07196 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFLP07196 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFLP07196 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms