Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAD1O00515 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAD1O00515 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAD1O00515 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAD1O00515 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAD1O00515 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAD1O00515 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAD1O00515 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAD1O00515 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAD1O00515 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAD1O00515 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAD1O00515 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAD1O00515 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAD1O00515 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAD1O00515 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAD1O00515 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAD1O00515 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAD1O00515 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAD1O00515 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAD1O00515 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAD1O00515 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAD1O00515 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAD1O00515 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAD1O00515 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAD1O00515 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAD1O00515 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAD1O00515 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAD1O00515 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAD1O00515 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAD1O00515 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAD1O00515 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAD1O00515 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAD1O00515 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAD1O00515 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAD1O00515 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAD1O00515 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAD1O00515 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAD1O00515 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAD1O00515 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAD1O00515 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAD1O00515 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAD1O00515 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAD1O00515 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAD1O00515 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAD1O00515 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAD1O00515 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms