Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROB1E7EW31 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.1 ms