Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms