Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT87PA6NCN2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms