Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVL5

Uncharacterized protein FLJ43738 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVL5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVL5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVL5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVL5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVL5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVL5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVL5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVL5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVL5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVL5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVL5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVL5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVL5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVL5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVL5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A1B0GVL5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVL5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms