Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI8

IGF2BP1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP1Q9NZI8 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.319e-9■■■■■ 42.6
IGF2BP1Q9NZI8 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.799e-9■■■■■ 42.6
IGF2BP1Q9NZI8 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.819e-9■■■■■ 42.6
IGF2BP1Q9NZI8 ASNS-217ENST00000495255 1678 ntTSL 211.62□□□□□ -0.558e-8■■■■■ 42.3
IGF2BP1Q9NZI8 GLB1-205ENST00000436768 558 ntTSL 322.79■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 42.3
IGF2BP1Q9NZI8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 42.3
IGF2BP1Q9NZI8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 42.3
IGF2BP1Q9NZI8 GLB1-219ENST00000498537 570 ntTSL 415.11■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 42.3
IGF2BP1Q9NZI8 GLB1-209ENST00000450835 540 ntTSL 413.58□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 42.3
IGF2BP1Q9NZI8 GLB1-211ENST00000464355 557 ntTSL 312.52□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 42.3
IGF2BP1Q9NZI8 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 42.3
IGF2BP1Q9NZI8 GLB1-204ENST00000415454 591 ntTSL 49.79□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 42.3
IGF2BP1Q9NZI8 GLB1-207ENST00000440656 626 ntTSL 48.72□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 42.3
IGF2BP1Q9NZI8 GLB1-216ENST00000485698 550 ntTSL 47.45□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 42.3
IGF2BP1Q9NZI8 GLB1-215ENST00000482097 547 ntTSL 57.45□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 42.3
IGF2BP1Q9NZI8 GLB1-206ENST00000438227 569 ntTSL 46.07□□□□□ -1.442e-7■■■■■ 42.3
IGF2BP1Q9NZI8 RFK-202ENST00000472900 753 ntTSL 317.39■□□□□ 0.372e-12■■■■■ 42.2
IGF2BP1Q9NZI8 RFK-203ENST00000476087 554 ntTSL 46.12□□□□□ -1.432e-12■■■■■ 42.2
IGF2BP1Q9NZI8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.228e-19■■■■■ 42.2
IGF2BP1Q9NZI8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.458e-19■■■■■ 42.2
IGF2BP1Q9NZI8 ARF1-201ENST00000272102 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.678e-19■■■■■ 42.2
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3E-208ENST00000519517 726 ntTSL 36.28□□□□□ -1.47e-8■■■■■ 42.1
IGF2BP1Q9NZI8 XPOT-204ENST00000540203 548 ntTSL 411.88□□□□□ -0.512e-13■■■■■ 42.1
IGF2BP1Q9NZI8 EIF2S3-203ENST00000457332 215 ntTSL 56.07□□□□□ -1.446e-21■■■■■ 41.9
IGF2BP1Q9NZI8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 41.9
IGF2BP1Q9NZI8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.812e-12■■■■■ 41.8
IGF2BP1Q9NZI8 TRIP6-206ENST00000476870 1750 ntTSL 218.85■□□□□ 0.612e-12■■■■■ 41.8
IGF2BP1Q9NZI8 SUZ12-203ENST00000578106 1367 ntTSL 28.26□□□□□ -1.092e-12■■■■■ 41.8
IGF2BP1Q9NZI8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.539e-15■■■■■ 41.8
IGF2BP1Q9NZI8 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.89□□□□□ -1.635e-49■■■■■ 41.8
IGF2BP1Q9NZI8 CLTC-206ENST00000475458 479 ntTSL 25.06□□□□□ -1.63e-10■■■■■ 41.8
IGF2BP1Q9NZI8 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.345e-10■■■■■ 41.7
IGF2BP1Q9NZI8 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.575e-10■■■■■ 41.7
IGF2BP1Q9NZI8 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.261e-11■■■■■ 41.6
IGF2BP1Q9NZI8 PCBD1-203ENST00000493961 389 ntTSL 211.88□□□□□ -0.511e-11■■■■■ 41.6
IGF2BP1Q9NZI8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.924e-9■■■■■ 41.5
IGF2BP1Q9NZI8 MC1R-201ENST00000539976 2464 ntTSL 513.84□□□□□ -0.194e-9■■■■■ 41.5
IGF2BP1Q9NZI8 MC1R-203ENST00000555427 3637 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.594e-9■■■■■ 41.5
IGF2BP1Q9NZI8 SEC24A-203ENST00000513123 650 ntTSL 55.28□□□□□ -1.564e-7■■■■■ 41.5
IGF2BP1Q9NZI8 VDAC2-211ENST00000475142 819 ntTSL 314.34□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 41.5
IGF2BP1Q9NZI8 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.081e-12■■■■■ 41.4
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-213ENST00000559711 1693 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 41.4
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-208ENST00000558285 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 41.4
IGF2BP1Q9NZI8 SSU72-204ENST00000378726 2238 ntTSL 219.51■□□□□ 0.713e-8■■■■■ 41.3
IGF2BP1Q9NZI8 RAB6A-209ENST00000541973 1104 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 41.2
IGF2BP1Q9NZI8 ASAH1-264ENST00000637898 664 ntTSL 215.51■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 41.1
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-218ENST00000560202 1681 ntTSL 511.28□□□□□ -0.63e-11■■■■■ 41.1
IGF2BP1Q9NZI8 DARS-202ENST00000422708 623 ntTSL 26.23□□□□□ -1.417e-13■■■■■ 41
IGF2BP1Q9NZI8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.567e-8■■■■■ 40.9
IGF2BP1Q9NZI8 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.37e-8■■■■■ 40.9
IGF2BP1Q9NZI8 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.37e-8■■■■■ 40.9
IGF2BP1Q9NZI8 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 312.34□□□□□ -0.437e-8■■■■■ 40.9
IGF2BP1Q9NZI8 ASNS-212ENST00000453600 573 ntTSL 314.76□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 40.9
IGF2BP1Q9NZI8 RAPGEF2-206ENST00000505478 838 ntTSL 55.1□□□□□ -1.595e-6■■■■■ 40.8
IGF2BP1Q9NZI8 AGRN-202ENST00000419249 861 ntTSL 318.26■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 PSMA1-212ENST00000532256 588 ntTSL 216.29■□□□□ 0.27e-8■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.566e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.186e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.146e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 PDCD6-203ENST00000505526 1484 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.096e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.076e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 313.48□□□□□ -0.256e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.276e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.276e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 PDCD6-210ENST00000513582 3500 ntTSL 211.41□□□□□ -0.586e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.816e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.67□□□□□ -0.866e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 ZMYND8-215ENST00000468376 4064 ntTSL 1 (best)9.59□□□□□ -0.876e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.946e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.956e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.026e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.046e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.156e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 37.8□□□□□ -1.166e-12■■■■■ 40.3
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.024e-8■■■■■ 40.2
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.264e-8■■■■■ 40.2
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.714e-8■■■■■ 40.2
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.874e-8■■■■■ 40.2
IGF2BP1Q9NZI8 CLTC-205ENST00000472651 665 ntTSL 25.04□□□□□ -1.62e-10■■■■■ 39.9
IGF2BP1Q9NZI8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.151e-10■■■■■ 39.9
IGF2BP1Q9NZI8 NRIP1-202ENST00000400199 7562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.681e-10■■■■■ 39.9
IGF2BP1Q9NZI8 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.431e-10■■■■■ 39.9
IGF2BP1Q9NZI8 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.731e-10■■■■■ 39.9
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3E-207ENST00000519413 419 ntTSL 35.88□□□□□ -1.479e-16■■■■■ 39.8
IGF2BP1Q9NZI8 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.985e-8■■■■■ 39.8
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3L-211ENST00000476955 583 ntTSL 58.58□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 39.8
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3L-206ENST00000439997 787 ntTSL 56.26□□□□□ -1.413e-7■■■■■ 39.8
IGF2BP1Q9NZI8 ETF1-202ENST00000499810 3874 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 39.7
IGF2BP1Q9NZI8 ETF1-201ENST00000360541 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 39.7
IGF2BP1Q9NZI8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.144e-9■■■■■ 39.7
IGF2BP1Q9NZI8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.014e-9■■■■■ 39.7
IGF2BP1Q9NZI8 KDELR2-202ENST00000382267 583 ntTSL 49.98□□□□□ -0.813e-9■■■■■ 39.6
IGF2BP1Q9NZI8 KMT2E-208ENST00000478079 597 ntTSL 55.28□□□□□ -1.569e-12■■■■■ 39.5
IGF2BP1Q9NZI8 NACA-210ENST00000548386 644 ntTSL 25.87□□□□□ -1.472e-11■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CCNDBP1-208ENST00000566515 1634 ntTSL 520.85■□□□□ 0.931e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CCNDBP1-204ENST00000563065 1450 ntTSL 217.36■□□□□ 0.371e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 TBL1XR1-213ENST00000450267 588 ntTSL 316.29■□□□□ 0.21e-12■■■■■ 39.4
Retrieved 100 of 17,531 protein–RNA pairs in 378.2 ms