RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541182.1

ARF1-214, Transcript of ADP ribosylation factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARF1, Length 2,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1-214ENST00000541182 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.11■■■■■ 4.01
ARF1-214ENST00000541182 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.99■■■■□ 3.19
ARF1-214ENST00000541182 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
ARF1-214ENST00000541182 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.17■■■□□ 2.9
ARF1-214ENST00000541182 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.09■■■□□ 2.89
ARF1-214ENST00000541182 ABCC9O60706 1549 aa33.01■■■□□ 2.88
ARF1-214ENST00000541182 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.75■■■□□ 2.83
ARF1-214ENST00000541182 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.72■■■□□ 2.83
ARF1-214ENST00000541182 NACADO15069 1562 aa32.55■■■□□ 2.8
ARF1-214ENST00000541182 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.27■■■□□ 2.76
ARF1-214ENST00000541182 SCRIBQ14160 1630 aa32.16■■■□□ 2.74
ARF1-214ENST00000541182 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.7■■■□□ 2.66
ARF1-214ENST00000541182 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
ARF1-214ENST00000541182 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.32■■■□□ 2.6
ARF1-214ENST00000541182 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.16■■■□□ 2.58
ARF1-214ENST00000541182 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.13■■■□□ 2.57
ARF1-214ENST00000541182 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
ARF1-214ENST00000541182 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.99■■■□□ 2.55
ARF1-214ENST00000541182 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
ARF1-214ENST00000541182 SMARCA4P51532 1647 aa30.84■■■□□ 2.53
ARF1-214ENST00000541182 WIZO95785 1651 aa30.77■■■□□ 2.52
ARF1-214ENST00000541182 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.46■■■□□ 2.47
ARF1-214ENST00000541182 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
ARF1-214ENST00000541182 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
ARF1-214ENST00000541182 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.3■■■□□ 2.44
ARF1-214ENST00000541182 SMARCA2P51531 1590 aa30.29■■■□□ 2.44
ARF1-214ENST00000541182 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.19■■■□□ 2.42
ARF1-214ENST00000541182 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
ARF1-214ENST00000541182 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.11■■■□□ 2.41
ARF1-214ENST00000541182 NCAPD3P42695 1498 aa30.04■■■□□ 2.4
ARF1-214ENST00000541182 HMGXB3Q12766 1538 aa30.01■■■□□ 2.39
ARF1-214ENST00000541182 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.9■■■□□ 2.38
ARF1-214ENST00000541182 TRIM41Q8WV44 630 aa29.62■■■□□ 2.33
ARF1-214ENST00000541182 ABCC8Q09428 1581 aa29.5■■■□□ 2.31
ARF1-214ENST00000541182 CFTRP13569 1480 aa29.38■■■□□ 2.29
ARF1-214ENST00000541182 PRDM2Q13029 1718 aa29.31■■■□□ 2.28
ARF1-214ENST00000541182 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.29■■■□□ 2.28
ARF1-214ENST00000541182 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.26■■■□□ 2.27
ARF1-214ENST00000541182 SYNJ1O43426 1573 aa29.19■■■□□ 2.26
ARF1-214ENST00000541182 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.11■■■□□ 2.25
ARF1-214ENST00000541182 TOP2BQ02880 1626 aa29.08■■■□□ 2.25
ARF1-214ENST00000541182 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
ARF1-214ENST00000541182 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.06■■■□□ 2.24
ARF1-214ENST00000541182 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.04■■■□□ 2.24
ARF1-214ENST00000541182 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.03■■■□□ 2.24
ARF1-214ENST00000541182 NESP48681 1621 aa29.01■■■□□ 2.23
ARF1-214ENST00000541182 CUX1P39880 1505 aa28.98■■■□□ 2.23
ARF1-214ENST00000541182 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.94■■■□□ 2.22
ARF1-214ENST00000541182 SOGA1O94964 1423 aa28.94■■■□□ 2.22
ARF1-214ENST00000541182 EEA1Q15075 1411 aa28.89■■■□□ 2.22
ARF1-214ENST00000541182 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.84■■■□□ 2.21
ARF1-214ENST00000541182 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.78■■■□□ 2.2
ARF1-214ENST00000541182 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.76■■■□□ 2.19
ARF1-214ENST00000541182 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.72■■■□□ 2.19
ARF1-214ENST00000541182 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.71■■■□□ 2.19
ARF1-214ENST00000541182 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.7■■■□□ 2.19
ARF1-214ENST00000541182 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.66■■■□□ 2.18
ARF1-214ENST00000541182 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.64■■■□□ 2.18
ARF1-214ENST00000541182 TOPBP1Q92547 1522 aa28.64■■■□□ 2.18
ARF1-214ENST00000541182 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
ARF1-214ENST00000541182 KIF27Q86VH2 1401 aa28.54■■■□□ 2.16
ARF1-214ENST00000541182 KIF21BO75037 1637 aa28.54■■■□□ 2.16
ARF1-214ENST00000541182 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
ARF1-214ENST00000541182 GOLGA3Q08378 1498 aa28.49■■■□□ 2.15
ARF1-214ENST00000541182 CUX2O14529 1486 aa28.46■■■□□ 2.15
ARF1-214ENST00000541182 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.41■■■□□ 2.14
ARF1-214ENST00000541182 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.41■■■□□ 2.14
ARF1-214ENST00000541182 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.4■■■□□ 2.14
ARF1-214ENST00000541182 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.39■■■□□ 2.14
ARF1-214ENST00000541182 PRXQ9BXM0 1461 aa28.37■■■□□ 2.13
ARF1-214ENST00000541182 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
ARF1-214ENST00000541182 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.35■■■□□ 2.13
ARF1-214ENST00000541182 WDR97A6NE52 1622 aa28.34■■■□□ 2.13
ARF1-214ENST00000541182 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.34■■■□□ 2.13
ARF1-214ENST00000541182 ERCC6Q03468 1493 aa28.29■■■□□ 2.12
ARF1-214ENST00000541182 IGF1RP08069 1367 aa28.29■■■□□ 2.12
ARF1-214ENST00000541182 WDR62O43379 1518 aa28.27■■■□□ 2.12
ARF1-214ENST00000541182 CEP162Q5TB80 1403 aa28.26■■■□□ 2.12
ARF1-214ENST00000541182 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
ARF1-214ENST00000541182 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
ARF1-214ENST00000541182 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.18■■■□□ 2.1
ARF1-214ENST00000541182 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.14■■■□□ 2.1
ARF1-214ENST00000541182 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
ARF1-214ENST00000541182 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.1■■■□□ 2.09
ARF1-214ENST00000541182 CUL7Q14999 1698 aa28.1■■■□□ 2.09
ARF1-214ENST00000541182 IFT140Q96RY7 1462 aa28.06■■■□□ 2.08
ARF1-214ENST00000541182 CLIP1P30622 1438 aa28.03■■■□□ 2.08
ARF1-214ENST00000541182 PBRM1Q86U86 1689 aa27.99■■■□□ 2.07
ARF1-214ENST00000541182 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.065e-7■■■■□ 21.3
ARF1-214ENST00000541182 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
ARF1-214ENST00000541182 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
ARF1-214ENST00000541182 GRIN2BQ13224 1484 aa27.87■■■□□ 2.05
ARF1-214ENST00000541182 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
ARF1-214ENST00000541182 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.82■■■□□ 2.04
ARF1-214ENST00000541182 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.8■■■□□ 2.04
ARF1-214ENST00000541182 ADAMTS12P58397 1594 aa27.8■■■□□ 2.04
ARF1-214ENST00000541182 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.79■■■□□ 2.04
ARF1-214ENST00000541182 ARAP1Q96P48 1450 aa27.77■■■□□ 2.04
ARF1-214ENST00000541182 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.76■■■□□ 2.03
ARF1-214ENST00000541182 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms