Protein–RNA interactions for Protein: Q96K19

RNF170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170Q96K19 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF170Q96K19 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF170Q96K19 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF170Q96K19 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF170Q96K19 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF170Q96K19 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF170Q96K19 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF170Q96K19 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF170Q96K19 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF170Q96K19 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF170Q96K19 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF170Q96K19 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF170Q96K19 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF170Q96K19 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF170Q96K19 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF170Q96K19 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF170Q96K19 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF170Q96K19 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF170Q96K19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF170Q96K19 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF170Q96K19 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF170Q96K19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF170Q96K19 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF170Q96K19 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF170Q96K19 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF170Q96K19 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF170Q96K19 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF170Q96K19 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF170Q96K19 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF170Q96K19 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF170Q96K19 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms