Protein–RNA interactions for Protein: Q6UDR6

SPINT4, Kunitz-type protease inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT4Q6UDR6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPINT4Q6UDR6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPINT4Q6UDR6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPINT4Q6UDR6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPINT4Q6UDR6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPINT4Q6UDR6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms