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Protein–RNA interactions for Protein: Q12090
REX3, RNA exonuclease 3, yeast
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404 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
REX3
Q12090
RDN25-2
RDN25-2
3396 nt
9.29
□□□□□ -0.92
REX3
Q12090
YCL074W
YCL074W
927 nt
9.27
□□□□□ -0.93
REX3
Q12090
CLB6
YGR109C
1143 nt
9.26
□□□□□ -0.93
REX3
Q12090
MCM5
YLR274W
2328 nt
9.26
□□□□□ -0.93
REX3
Q12090
RFC1
YOR217W
2586 nt
9.25
□□□□□ -0.93
REX3
Q12090
YHL019W-A
YHL019W-A
594 nt
9.25
□□□□□ -0.93
REX3
Q12090
HSP60
YLR259C
1719 nt
9.25
□□□□□ -0.93
REX3
Q12090
DTR1
YBR180W
1719 nt
9.25
□□□□□ -0.93
REX3
Q12090
HEM14
YER014W
1620 nt
9.24
□□□□□ -0.93
REX3
Q12090
TIR3
YIL011W
810 nt
9.23
□□□□□ -0.93
REX3
Q12090
COQ2
YNR041C
1119 nt
9.23
□□□□□ -0.93
REX3
Q12090
NBP35
YGL091C
987 nt
9.22
□□□□□ -0.93
REX3
Q12090
YMR226C
YMR226C
804 nt
9.22
□□□□□ -0.93
REX3
Q12090
RPL4B
YDR012W
1089 nt
9.21
□□□□□ -0.94
REX3
Q12090
RPL4A
YBR031W
1089 nt
9.21
□□□□□ -0.94
REX3
Q12090
STR3
YGL184C
1398 nt
9.21
□□□□□ -0.94
REX3
Q12090
SFA1
YDL168W
1161 nt
9.2
□□□□□ -0.94
REX3
Q12090
ILV2
YMR108W
2064 nt
9.2
□□□□□ -0.94
REX3
Q12090
YDR510C-A
YDR510C-A
117 nt
9.19
□□□□□ -0.94
REX3
Q12090
YLR111W
YLR111W
333 nt
9.19
□□□□□ -0.94
REX3
Q12090
SDH5
YOL071W
489 nt
9.18
□□□□□ -0.94
REX3
Q12090
RBG2
YGR173W
1107 nt
9.17
□□□□□ -0.94
REX3
Q12090
YML089C
YML089C
369 nt
9.17
□□□□□ -0.94
REX3
Q12090
LSC2
YGR244C
1284 nt
9.16
□□□□□ -0.94
REX3
Q12090
UTH1
YKR042W
1098 nt
9.16
□□□□□ -0.94
REX3
Q12090
NAR1
YNL240C
1476 nt
9.15
□□□□□ -0.94
REX3
Q12090
MAS1
YLR163C
1389 nt
9.15
□□□□□ -0.94
REX3
Q12090
FUR4
YBR021W
1902 nt
9.13
□□□□□ -0.95
REX3
Q12090
TOM6
YOR045W
186 nt
9.12
□□□□□ -0.95
REX3
Q12090
RDN18-1
RDN18-1
1800 nt
9.12
□□□□□ -0.95
REX3
Q12090
RDN18-2
RDN18-2
1800 nt
9.12
□□□□□ -0.95
REX3
Q12090
CMP2
YML057W
1815 nt
9.11
□□□□□ -0.95
REX3
Q12090
POM34
YLR018C
900 nt
9.1
□□□□□ -0.95
REX3
Q12090
ATG15
YCR068W
1563 nt
9.1
□□□□□ -0.95
REX3
Q12090
PRO1
YDR300C
1287 nt
9.09
□□□□□ -0.95
REX3
Q12090
PEX2
YJL210W
816 nt
9.09
□□□□□ -0.95
REX3
Q12090
SHH4
YLR164W
507 nt
9.09
□□□□□ -0.95
REX3
Q12090
NRT1
YOR071C
1797 nt
9.09
□□□□□ -0.95
REX3
Q12090
RTN2
YDL204W
1182 nt
9.08
□□□□□ -0.96
REX3
Q12090
RPS14B
YJL191W
417 nt
9.07
□□□□□ -0.96
REX3
Q12090
MET28
YIR017C
564 nt
9.06
□□□□□ -0.96
REX3
Q12090
TSC10
YBR265W
963 nt
9.06
□□□□□ -0.96
REX3
Q12090
HIP1
YGR191W
1812 nt
9.05
□□□□□ -0.96
REX3
Q12090
RSC4
YKR008W
1878 nt
9.05
□□□□□ -0.96
REX3
Q12090
RAD23
YEL037C
1197 nt
9.04
□□□□□ -0.96
REX3
Q12090
HMG2
YLR450W
3138 nt
9.04
□□□□□ -0.96
REX3
Q12090
ARP6
YLR085C
1317 nt
9.04
□□□□□ -0.96
REX3
Q12090
BMT6
YLR063W
1098 nt
9.02
□□□□□ -0.97
REX3
Q12090
GAP1
YKR039W
1809 nt
9.02
□□□□□ -0.97
REX3
Q12090
GTB1
YDR221W
2109 nt
9.02
□□□□□ -0.97
REX3
Q12090
FIT3
YOR383C
615 nt
9.01
□□□□□ -0.97
REX3
Q12090
YGR259C
YGR259C
441 nt
9
□□□□□ -0.97
REX3
Q12090
TPO4
YOR273C
1980 nt
8.99
□□□□□ -0.97
REX3
Q12090
TIF6
YPR016C
738 nt
8.99
□□□□□ -0.97
REX3
Q12090
YGR012W
YGR012W
1182 nt
8.98
□□□□□ -0.97
REX3
Q12090
YKR005C
YKR005C
1578 nt
8.98
□□□□□ -0.97
REX3
Q12090
PLB1
YMR008C
1995 nt
8.96
□□□□□ -0.98
REX3
Q12090
PRP4
YPR178W
1398 nt
8.96
□□□□□ -0.98
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Q12090
SAM35
YHR083W
990 nt
8.94
□□□□□ -0.98
REX3
Q12090
SAM1
YLR180W
1149 nt
8.93
□□□□□ -0.98
REX3
Q12090
AAC1
YMR056C
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8.92
□□□□□ -0.98
REX3
Q12090
URA8
YJR103W
1737 nt
8.91
□□□□□ -0.98
REX3
Q12090
GAL2
YLR081W
1725 nt
8.91
□□□□□ -0.98
REX3
Q12090
YPL222C-A
YPL222C-A
246 nt
8.91
□□□□□ -0.98
REX3
Q12090
RIB3
YDR487C
627 nt
8.9
□□□□□ -0.98
REX3
Q12090
UGA4
YDL210W
1716 nt
8.9
□□□□□ -0.98
REX3
Q12090
TOK1
YJL093C
2076 nt
8.87
□□□□□ -0.99
REX3
Q12090
YAR028W
YAR028W
705 nt
8.87
□□□□□ -0.99
REX3
Q12090
YLR279W
YLR279W
390 nt
8.87
□□□□□ -0.99
REX3
Q12090
DPS1
YLL018C
1674 nt
8.87
□□□□□ -0.99
REX3
Q12090
ALP1
YNL270C
1722 nt
8.86
□□□□□ -0.99
REX3
Q12090
MAE1
YKL029C
2010 nt
8.85
□□□□□ -0.99
REX3
Q12090
UTR1
YJR049C
1593 nt
8.84
□□□□□ -0.99
REX3
Q12090
DIF1
YLR437C
402 nt
8.84
□□□□□ -0.99
REX3
Q12090
YDR306C
YDR306C
1437 nt
8.83
□□□□□ -1
REX3
Q12090
IRC24
YIR036C
792 nt
8.83
□□□□□ -1
REX3
Q12090
YLR437C-A
YLR437C-A
228 nt
8.83
□□□□□ -1
REX3
Q12090
AKR2
YOR034C
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□□□□□ -1
REX3
Q12090
MSB4
YOL112W
1479 nt
8.81
□□□□□ -1
REX3
Q12090
BIO5
YNR056C
1686 nt
8.78
□□□□□ -1
REX3
Q12090
GND1
YHR183W
1470 nt
8.77
□□□□□ -1
REX3
Q12090
GNP1
YDR508C
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8.77
□□□□□ -1
REX3
Q12090
YPI1
YFR003C
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□□□□□ -1.01
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Q12090
MTG2
YHR168W
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Q12090
PBP1
YGR178C
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□□□□□ -1.01
REX3
Q12090
SED1
YDR077W
1017 nt
8.74
□□□□□ -1.01
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Q12090
LOT5
YKL183W
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8.74
□□□□□ -1.01
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Q12090
SNF1
YDR477W
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□□□□□ -1.01
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Q12090
PRM5
YIL117C
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□□□□□ -1.01
REX3
Q12090
CYT2
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□□□□□ -1.01
REX3
Q12090
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YBR046C
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□□□□□ -1.01
REX3
Q12090
ALD4
YOR374W
1560 nt
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□□□□□ -1.02
REX3
Q12090
PUS7
YOR243C
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□□□□□ -1.02
REX3
Q12090
YJL195C
YJL195C
702 nt
8.7
□□□□□ -1.02
REX3
Q12090
LIP1
YMR298W
453 nt
8.7
□□□□□ -1.02
REX3
Q12090
THI72
YOR192C
1800 nt
8.7
□□□□□ -1.02
REX3
Q12090
FRA1
YLL029W
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□□□□□ -1.02
REX3
Q12090
CAB5
YDR196C
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8.69
□□□□□ -1.02
REX3
Q12090
APT2
YDR441C
546 nt
8.68
□□□□□ -1.02
REX3
Q12090
FUN14
YAL008W
597 nt
8.67
□□□□□ -1.02
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