Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP62P37198 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP62P37198 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP62P37198 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP62P37198 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62P37198 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62P37198 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62P37198 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62P37198 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62P37198 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62P37198 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62P37198 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62P37198 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62P37198 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62P37198 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62P37198 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62P37198 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62P37198 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62P37198 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62P37198 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62P37198 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62P37198 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62P37198 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62P37198 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62P37198 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62P37198 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62P37198 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62P37198 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62P37198 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62P37198 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62P37198 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62P37198 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62P37198 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62P37198 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62P37198 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP62P37198 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP62P37198 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP62P37198 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP62P37198 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP62P37198 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP62P37198 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP62P37198 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP62P37198 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP62P37198 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP62P37198 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP62P37198 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP62P37198 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP62P37198 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP62P37198 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP62P37198 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP62P37198 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP62P37198 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP62P37198 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP62P37198 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP62P37198 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP62P37198 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP62P37198 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP62P37198 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP62P37198 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP62P37198 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP62P37198 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP62P37198 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP62P37198 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP62P37198 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP62P37198 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP62P37198 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP62P37198 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP62P37198 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP62P37198 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP62P37198 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP62P37198 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP62P37198 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP62P37198 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP62P37198 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP62P37198 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP62P37198 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP62P37198 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP62P37198 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP62P37198 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP62P37198 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP62P37198 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62P37198 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62P37198 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62P37198 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62P37198 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62P37198 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62P37198 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62P37198 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62P37198 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62P37198 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62P37198 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP62P37198 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP62P37198 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP62P37198 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP62P37198 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP62P37198 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP62P37198 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP62P37198 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP62P37198 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP62P37198 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms