Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFRSF10AO00220 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNFRSF10AO00220 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFRSF10AO00220 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF10AO00220 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF10AO00220 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF10AO00220 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNFRSF10AO00220 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFRSF10AO00220 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFRSF10AO00220 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFRSF10AO00220 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFRSF10AO00220 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFRSF10AO00220 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFRSF10AO00220 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFRSF10AO00220 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFRSF10AO00220 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFRSF10AO00220 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFRSF10AO00220 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFRSF10AO00220 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNFRSF10AO00220 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNFRSF10AO00220 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TNFRSF10AO00220 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNFRSF10AO00220 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFRSF10AO00220 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFRSF10AO00220 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFRSF10AO00220 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFRSF10AO00220 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNFRSF10AO00220 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNFRSF10AO00220 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNFRSF10AO00220 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNFRSF10AO00220 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFRSF10AO00220 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFRSF10AO00220 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFRSF10AO00220 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFRSF10AO00220 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFRSF10AO00220 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFRSF10AO00220 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFRSF10AO00220 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFRSF10AO00220 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFRSF10AO00220 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFRSF10AO00220 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFRSF10AO00220 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFRSF10AO00220 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNFRSF10AO00220 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNFRSF10AO00220 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFRSF10AO00220 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFRSF10AO00220 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFRSF10AO00220 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNFRSF10AO00220 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNFRSF10AO00220 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFRSF10AO00220 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFRSF10AO00220 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFRSF10AO00220 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFRSF10AO00220 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFRSF10AO00220 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFRSF10AO00220 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNFRSF10AO00220 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNFRSF10AO00220 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFRSF10AO00220 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNFRSF10AO00220 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFRSF10AO00220 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFRSF10AO00220 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
TNFRSF10AO00220 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFRSF10AO00220 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFRSF10AO00220 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFRSF10AO00220 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFRSF10AO00220 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms