Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3KT08 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3KT08 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3KT08 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3KT08 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3KT08 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
J3KT08 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KT08 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KT08 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KT08 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3KT08 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KT08 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3KT08 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KT08 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KT08 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KT08 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KT08 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KT08 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KT08 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KT08 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KT08 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KT08 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KT08 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KT08 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KT08 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KT08 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KT08 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KT08 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KT08 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KT08 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KT08 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KT08 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KT08 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KT08 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KT08 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KT08 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KT08 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KT08 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KT08 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KT08 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KT08 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KT08 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KT08 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KT08 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KT08 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KT08 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KT08 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KT08 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KT08 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KT08 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KT08 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KT08 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KT08 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KT08 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KT08 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KT08 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KT08 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KT08 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KT08 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KT08 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KT08 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KT08 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KT08 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KT08 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KT08 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KT08 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KT08 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KT08 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KT08 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KT08 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KT08 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KT08 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3KT08 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3KT08 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3KT08 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KT08 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KT08 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KT08 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KT08 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KT08 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KT08 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KT08 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KT08 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KT08 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KT08 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KT08 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KT08 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KT08 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KT08 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KT08 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3KT08 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3KT08 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KT08 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KT08 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KT08 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KT08 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KT08 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KT08 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KT08 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KT08 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms