Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARFGEF2Q9Y6D5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGEF2Q9Y6D5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms