Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZDHHC3Q9NYG2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms