Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms