Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP33Q8TEY7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP33Q8TEY7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP33Q8TEY7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP33Q8TEY7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP33Q8TEY7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP33Q8TEY7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP33Q8TEY7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP33Q8TEY7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP33Q8TEY7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP33Q8TEY7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms