Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAG3L4Q8TBR4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms