Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE3Q8IX30 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms