Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR53Q7Z5U6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms