Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms