Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIK1Q3SY52 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms