Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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EXT1Q16394 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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EXT1Q16394 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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EXT1Q16394 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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EXT1Q16394 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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EXT1Q16394 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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EXT1Q16394 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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EXT1Q16394 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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EXT1Q16394 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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EXT1Q16394 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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EXT1Q16394 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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EXT1Q16394 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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EXT1Q16394 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXT1Q16394 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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