Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D2Q14995 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D2Q14995 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D2Q14995 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D2Q14995 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D2Q14995 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D2Q14995 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D2Q14995 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D2Q14995 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D2Q14995 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D2Q14995 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D2Q14995 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NR1D2Q14995 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D2Q14995 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D2Q14995 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NR1D2Q14995 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D2Q14995 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D2Q14995 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D2Q14995 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D2Q14995 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D2Q14995 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D2Q14995 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D2Q14995 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D2Q14995 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D2Q14995 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D2Q14995 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D2Q14995 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D2Q14995 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D2Q14995 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D2Q14995 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D2Q14995 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D2Q14995 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D2Q14995 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D2Q14995 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D2Q14995 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NR1D2Q14995 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NR1D2Q14995 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NR1D2Q14995 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1D2Q14995 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1D2Q14995 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms