Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNF4GQ14541 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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