Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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