Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH15P55291 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH15P55291 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH15P55291 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH15P55291 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH15P55291 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH15P55291 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH15P55291 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH15P55291 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH15P55291 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH15P55291 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH15P55291 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH15P55291 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH15P55291 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH15P55291 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH15P55291 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH15P55291 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH15P55291 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH15P55291 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH15P55291 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH15P55291 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH15P55291 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH15P55291 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH15P55291 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH15P55291 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH15P55291 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH15P55291 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH15P55291 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH15P55291 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH15P55291 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH15P55291 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH15P55291 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH15P55291 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH15P55291 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH15P55291 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH15P55291 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH15P55291 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH15P55291 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH15P55291 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDH15P55291 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH15P55291 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH15P55291 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH15P55291 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH15P55291 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH15P55291 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH15P55291 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH15P55291 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH15P55291 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH15P55291 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH15P55291 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDH15P55291 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH15P55291 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms