Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms